Genômica funcional de fungos micoparasitas

A revolução da genômica tem mudado o paradigma para a análise dos processos e sistemas biológicos. Atualmente, esses processos e sistemas podem ser descritos baseados na comparação global e quantitativa dos padrões de expressão gênica de células e tecidos, representando diferentes situações experimentais. Uma variedade de técnicas inovadoras tem sido desenvolvida nesse sentido para analisar a expressão gênica ao nível de mRNA (transcriptoma). Tais métodos incluem microarrays (SCHENA et al., 1995), differential display (LIANG e PARDEE, 1992), SAGE (VELCULESCU et al., 1995), cDNA AFLP (BACHEM et al., 1996), TOGA (SUTCLIFFE et al., 2000) e GC (SHIMKETS et al., 1999). No entanto, a descoberta de mecanismos pós-transcricionais que controlam a taxa de síntese e a meia-vida das proteínas (VARSHAVSKY, 1996) e a ausência de uma correlação preditiva entre os níveis de proteínas e seus mRNAs correspondentes (FUTCHER et al., 1999; GYGI et al., 1999) indicam que a análise do conteúdo total de proteínas (proteoma) também é necessária. Nesse sentido, a proteômica surge como uma importante ferramenta para a análise funcional dos genomas, com o potencial de acelerar a previsão da função de genes desconhecidos. A proteômica pode ser definida como a análise global da expressão gênica ao nível de proteína, e o método padrão de análise combina a separação de proteínas em gel de eletroforese bi-dimensional (2-DE) com a identificação das proteínas selecionadas por espectrometria de massa. A presente linha de pesquisa, desenvolvida no Laboratório de Estudos em Meio Ambiente – LEMA da Universidade Católica do Salvador – UCSal, consiste na análise funcional de genomas de fungos micoparasitas, com ênfase em proteômica, visando um melhor entendimento do mecanismo biológico envolvido no processo de micoparasitismo de fungos fitopatogênicos. O projeto que vem sendo desenvolvido atualmente nesta linha de pesquisa é o “Projeto Proteoma de Trichoderma stromaticum: identificação, caracterização e análise funcional de proteínas envolvidas no controle biológico do patógeno de cacau Crinipellis perniciosa”. O presente projeto investiga o proteoma de Trichoderma stromaticum, que tem sido considerado como um dos agentes de controle biológico de maior potencial no combate à vassoura-de-bruxa do cacaueiro, causada por Crinipellis perniciosa. Essa investigação permitirá o isolamento das proteínas e dos genes relacionados ao processo de micoparasitismo e, em ações de pesquisas posteriores e com base nos dados a serem gerados neste projeto, estabelecer-se-á alternativas consistentes e instrumentos eficazes para o controle econômica e ecologicamente sustentável de C. perniciosa. O projeto conta com a participação de diferentes instituições colaboradoras, como UnB, UESC, EMBRAPA/CENARGEN e Almirante Cacau/M&M Mars.